Narzędzia specjalne to specjalne narzędzia, które są produkowane zgodnie z indywidualnymi wymaganiami klienta. Są one używane głównie wtedy, gdy zadanie produkcyjne nie może być wykonywane przy użyciu standardowych narzędzi. Dzieje się tak na przykład wtedy, gdy zadanie obróbcze jest zbyt złożone dla standardowych narzędzi lub gdy pożądany jest krótszy czas cyklu. W praktyce konieczne jest wówczas użycie kilku narzędzi, co skutkuje dłuższymi przestojami, większym zużyciem i większą podatnością na błędy.
Alternatywą w takim przypadku jest narzędzie specjalne. Są to narzędzia produkowane specjalnie na indywidualne potrzeby. Może to być na przykład mieszanka różnych narzędzi, za pomocą których można wykonać kilka operacji bez przestojów. Istnieją również specjalne narzędzia do poszczególnych etapów pracy, których geometria jest wyposażona w specjalne dodatki. Specjalne narzędzia wykonane z różnych materiałów, takich jak węgliki spiekane, mogą być również produkowane całkowicie zgodnie z życzeniem klienta.
Ze względu na praktycznie nieograniczoną różnorodność kształtów, frezy specjalne są stosowane głównie w przypadku złożonych procesów frezowania i wiercenia oraz dużych prędkości skrawania. Częstym obszarem zastosowań jest na przykład wiercenie stopniowe. W tym przypadku specjalne narzędzie zapewnia dużą oszczędność czasu, ponieważ wszystkie stopnie można wykonać w jednej operacji i ponieważ mają one bardzo długą żywotność przy zastosowaniu wysokowydajnych materiałów. Innym obszarem zastosowań są na przykład narzędzia do rozwiercania i formowania, za pomocą których można wytwarzać określone geometrie i kształty w jednej operacji.